金關(guān)工程（二期）經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)立項(xiàng)，是 “十二五”期間國(guó)家重大電子政務(wù)工程項(xiàng)目。金關(guān)工程二期為國(guó)家、社會(huì)公眾提供海關(guān)業(yè)務(wù)服務(wù)和信息資源服務(wù)，為構(gòu)建開(kāi)放型國(guó)家經(jīng)濟(jì)新體制提供了有力支撐，為落實(shí)國(guó)家一帶一路、跨境新政、全國(guó)一體化通關(guān)改革等重大決策提供了有力保障。金關(guān)工程（二期）已于2018年2月通過(guò)竣工驗(yàn)收，并已正式上線運(yùn)行。金關(guān)工程（二期）加工貿(mào)易管理系統(tǒng)是金關(guān)工程（二期）的重要組成部分，該系統(tǒng)的上線運(yùn)行和推廣應(yīng)用為海關(guān)深化加工貿(mào)易及保稅監(jiān)管改革、支持加工貿(mào)易創(chuàng)新發(fā)展提供有力的技術(shù)支持和保障。

金關(guān)工程（二期）加工貿(mào)易管理系統(tǒng)是金關(guān)工程（二期）的重要二級(jí)系統(tǒng)，由加工貿(mào)易手冊(cè)管理分系統(tǒng)、加工貿(mào)易賬冊(cè)管理分系統(tǒng)、保稅流轉(zhuǎn)管理分系統(tǒng)等多個(gè)分系統(tǒng)組成。加工貿(mào)易手冊(cè)管理分系統(tǒng)延續(xù)現(xiàn)有加工貿(mào)易手冊(cè)管理基本形式，總體上仍設(shè)置有建賬、扣賬、核賬三大環(huán)節(jié)，結(jié)合料號(hào)級(jí)管理，風(fēng)險(xiǎn)分析，智能化作業(yè)，分層級(jí)管理等要求進(jìn)行整合設(shè)計(jì)，打造新型加工貿(mào)易手冊(cè)管理模式。加工貿(mào)易賬冊(cè)管理分系統(tǒng)實(shí)施更貼近企業(yè)生產(chǎn)實(shí)際的料號(hào)級(jí)管理，料號(hào)級(jí)備案、料號(hào)級(jí)清單核注底賬、項(xiàng)號(hào)級(jí)通關(guān)、料號(hào)級(jí)核銷。保稅流轉(zhuǎn)管理分系統(tǒng)建立保稅貨物流轉(zhuǎn)管理統(tǒng)一的信息化平臺(tái)，實(shí)現(xiàn)對(duì)保稅貨物流轉(zhuǎn)管理的無(wú)紙化作業(yè)、信息化管理、智能化審核。

南京海關(guān)采取分步推廣方式推廣應(yīng)用金關(guān)工程（二期）加工貿(mào)易管理系統(tǒng)，按照總署統(tǒng)一部署，自2019年1月15日起，在部分企業(yè)開(kāi)展測(cè)試，并自2019年4月1日開(kāi)始在蘇州、蘇州工業(yè)園區(qū)、無(wú)錫、鹽城和昆山海關(guān)，分別應(yīng)用手冊(cè)和電子賬冊(cè)系統(tǒng)，其他海關(guān)推廣應(yīng)用也于6月10日開(kāi)始。

企業(yè)可通過(guò)國(guó)際貿(mào)易“單一窗口”或“互聯(lián)網(wǎng)+海關(guān)”一體化網(wǎng)上辦事平臺(tái)等方式辦理金關(guān)二期加工貿(mào)易進(jìn)料加工手冊(cè)、來(lái)料加工手冊(cè)、不作價(jià)設(shè)備手冊(cè)和電子賬冊(cè)的設(shè)立、變更、核銷、結(jié)轉(zhuǎn)、外發(fā)等各項(xiàng)手續(xù)。新舊兩套系統(tǒng)同步運(yùn)作，逐步將手（賬）冊(cè)設(shè)立過(guò)渡至金關(guān)工程（二期）加工貿(mào)易管理系統(tǒng)，原有H2010加工貿(mào)易管理系統(tǒng)停止系統(tǒng)更新。

自2019年8月1日起，加工貿(mào)易手（賬）冊(cè)設(shè)立原則上一律通過(guò)金關(guān)工程（二期）加工貿(mào)易管理系統(tǒng)進(jìn)行，全面停止H2010加工貿(mào)易管理系統(tǒng)的手（賬）冊(cè)設(shè)立、延期（因余料結(jié)轉(zhuǎn)、內(nèi)銷征稅等特殊情況延期的除外），原有H2010手（賬）冊(cè)可正常執(zhí)行完畢；H2010不作價(jià)設(shè)備手冊(cè)停止設(shè)備進(jìn)口報(bào)關(guān)。因電子賬冊(cè)企業(yè)需同步對(duì)企業(yè)信息化系統(tǒng)進(jìn)行改造，對(duì)在8月1日前難以完成信息化系統(tǒng)改造的電子賬冊(cè)企業(yè)，可對(duì)切換時(shí)間視情況予以延期，最遲不得超過(guò)2019年12月31日。

金關(guān)工程（二期）加工貿(mào)易管理系統(tǒng)中新設(shè)立的區(qū)外加工貿(mào)易手冊(cè)（含不作價(jià)設(shè)備手冊(cè)）、電子賬冊(cè)的設(shè)立（變更）、核銷仍采取集中作業(yè)模式，由南京海關(guān)加工貿(mào)易集中作業(yè)中心辦理。

新設(shè)立的保稅維修、保稅檢測(cè)、保稅研發(fā)的手冊(cè)、電子賬冊(cè)以及出境加工賬冊(cè)的設(shè)立（變更）、核銷由業(yè)務(wù)現(xiàn)場(chǎng)辦理。業(yè)務(wù)現(xiàn)場(chǎng)還負(fù)責(zé)辦理核注清單的審核和修改、刪除業(yè)務(wù)。